白色，有白玉、星月、白玉根等菩提，容易上色；红色，有海红豆等，颜色红的发亮；黄色，有金刚菩提等，色调丰富，盘玩后呈橘黄色；绿色，有阴皮星月菩提等，颜色为淡绿色并带有白点；紫色，有紫金鼠菩提等，盘玩后颜色为紫中带红或紫中偏金等。
1、白色
菩提的颜色种类非常多，白色的菩提有白玉菩提、星月菩提、银钱菩提、白玉根等，白色的菩提非常容易上色，经常被染成各种颜色，市场上见到的染色菩提多为天然的白色菩提。
2、红色
天然的红色菩提有海红豆等，海红豆又被叫做红心菩提子，颜色鲜红艳丽，红的发亮，看起来非常晶莹剔透，形状像心脏一样，内部有心型的曲线，看起来非常独特美丽。
3、黄色
黄色菩提有金刚菩提、凤眼菩提等，黄色凤眼菩提很受玩家们的欢迎，其色调丰富，有黄色、金黄色、姜黄色等，皮质厚实，有厚重感，色泽黄中透红，盘玩后的颜色呈现出橘黄色。
4、绿色
天然绿色的菩提非常稀少，主要有阴皮星月菩提等，阴皮星月菩提的颜色绿中会带有一一点点白色，全绿色的阴皮星月品质最好，并且油性非常足，上色包浆非常快，特别适合盘玩。
5、紫色
紫色的菩提有紫金鼠菩提等，紫金鼠菩提的一端有三个小洞，看起来很像老鼠的尾巴，颜色呈现出紫色，所以叫紫金鼠菩提，经过盘玩后的颜色为紫中偏红或紫中泛金，非常漂亮。